Пытанні двухбаковых адносін, уключаючы палітычны дыялог, гандлёва-эканамічнае і гуманітарнае супрацоўніцтва, удасканаленне дагаворна-прававой базы, а таксама беларуска-эстонскае ўзаемадзеянне ў рамках міжнародных арганізацый і па лініі Беларусь – ЕС абмяркоўваюцца на кансультацых паміж міністэрствамі замежных спраў Беларусі і Эстоніі ў Таліне.